F2 Praktikum Protein Kristallisation, Wintersemester 2013 2014
F2 Praktikum 2. Block
Fan Zhang und Tilman Lamparter
Weiteres Material hier. 
Fragensammlung zur Vorbereitung auf Klausur.
Programm
Vorlesung und Seminar finden auf deutsch statt, manche Folien sind auf englisch. Das Seminar findet im Raum 002 der Botanik 1 (Geb. 10.40) statt.
| Vorlesung | Seminar | Gruppe 1 | Gruppe 2 | Gruppe 3 | Gruppe 4 | |
| wochenweise | ||||||
| Montag, 25. November 2013 | 10:30: Einführung | PhrB Y424F | PhrB Y424F | Agp2-M1 | Agp2-M1 | |
| Dienstag, 26. November 2013 | 10:30 Protein Techniken | Kristallisation | Kristallisation | Kristallisation | Kristallisation | |
| Mittwoch, 27. November 2013 | 10:00 DNA Techniken | Vorbereitungen | Vorbereitungen | Reinigung | Reinigung | |
| Donnerstag, 28. November 2013 | Kristallisation 1 | Expression | Expression | Mutagenese | Mutagenese | |
| Freitag, 29. November 2013 | ||||||
| Montag, 2. Dezember 2013 | Kristallisation | Kristallisation | Kristallisation | Kristallisation | ||
| Dienstag, 3. Dezember 2013 | 10:30 Thema 1 | Reinigung | Reinigung | Expression | Expression | |
| Mittwoch, 4. Dezember 2013 | 10:00 Phytochrom | Mutagenese | Mutagenese | Reinigung | Reinigung | |
| Donnerstag, 5. Dezember 2013 | 10:00 Thema 3 | |||||
| Freitag, 6. Dezember 2013 | 10:00 Thema 4 | |||||
| Montag, 9. Dezember 2013 | 10:30 Phytochrom | Kristallisation | Kristallisation | Reinigung | Reinigung | |
| Dienstag, 10. Dezember 2013 | 10:30 Phytochrom | HPLC mit DNA | HPLC mit DNA | Kristallisation | Kristallisation | |
| Mittwoch, 11. Dezember 2013 | Thema 5+6 | Photoreparatur | Photoreparatur | Charakterisierung | Charakterisierung | |
| Donnerstag, 12. Dezember 2013 | 10:00 Photolyase |
|
Agp2-M1 | Agp2-M1 | ||
| Freitag, 13. Dezember 2013 | 10:00 Thema 7+ 8 |
|||||
| Montag, 16. Dezember 2013 | Reinigung | Reinigung | Kristallisation | Kristallisation | ||
| Dienstag, 17. Dezember 2013 | Kristallisation | Kristallisation | Charakterisierung | Charakterisierung | ||
| Mittwoch, 18. Dezember 2013 | 10:00 Referate | Agp2-M1 | Agp2-M1 | |||
| Donnerstag, 19. Dezember 2013 | ||||||
| Freitag, 20. Dezember 2013 | 10:30 Klausur |
Themen für Seminar (ein Thema pro Studierender)
Macromolecular Crystallography Protocols Band 1+2, 2007 (Bücher in der Botanik 1, Raum 001, pdf Version hier. )
Thema 1: A Generic Method for the Production of Recombinant Proteins in Escherichia coli Using a Dual Hexahistidine-Maltose-Binding Protein Affinity Tag. Joseph E. Tropea, Scott Cherry, Sreedevi Nallamsetty, Christophe Bignon, and David S. Waugh Bd. 1,pp. 1-20
Thema 2: Protein Engineering. Sonia Longhi, François Ferron, and Marie-Pierre Egloff; Bd. 1,pp. 59-90
Thema 3: Production of Selenomethionyl Proteins in Prokaryotic and Eukaryotic Expression Systems. Sylvie Doublié; Bd. 1, pp. 91-108
Thema 4: Screening and Optimization Methods for Nonautomated Crystallization Laboratories. Terese Bergfors; Bd. 1, pp. 131-152
Thema 5: Improving Marginal Crystals. Charles W. Carter, Jr. and Madeleine Riès-Kautt; Bd. 1, pp. 153- 174
Thema 6: Cryocrystallography of Macromolecules: Practice and Optimization. Elspeth Garman and Robin L. Owen; Bd. 2, pp. 1-18
Thema 7: Characterizing a Crystal From an Initial Native Dataset. Michael R. Sawaya ; Bd. 2, pp. 95-120
Thema 8: Molecular Replacement. Eric A. Toth; Bd. 2, pp. 121-148
Teilnehmer und Themen
Die Themen sind unter "Seminar" aufgelistet. An den jeweiligen Tagen stellen die Teilnehmer den zugeteilten Artikel vor. Dauer 15-30 min.
Gruppe A:
Reuster, Jennifer: 6
Sülzle, Anja: 3
Gruppe B:
Epple, Philipp: 4
Pinecker, Christoph: 5
Gruppe C:
Nikoloff, Jonas: 8
Bai, Yingnan: 2?
Gruppe D:
Knott, Jenny: 1
Setzer, Tabea: 7