Bioinformatik Sommersemester 2014 im Modul 4
- Ansprechperson:
Tilman Lamparter, Jörg Kämper, Johannes Gescher u.a.
Unterlagen zur 2015 Veranstaltung finden Sie hier.
Für die Übungen sind 8 Gruppen vorgesehen. Die Gruppeneinteilung finden Sie unten.
Für die Übungen brauchen je zwei Studierende ein Notebook mit WLAN Zugang.Bitte sprechen Sie ich innerhalb der Gruppe ab und melden sich rechtzeitig bei mir (TL), falls die eigenen Notebooks nicht ausreichen. Bitte installieren Sie rechtzeitig die unten aufgelisteten Programme.
Zu den Übungen Sequenzvergleiche und Phylogenie
Zeitplan für Vorlesungen und Übungen
| Tag | Uhrzeit | Hörsaal | Thema | Dozent |
| Freitag, 13. Juni 2014 | 9:45-11:15 | Geb. 30.21 Gerthsen HS | Paarweises alignment, BLAST | Lamparter |
| Freitag, 20. Juni 2014 | 9:45-11:15 | Geb. 30.21 Gerthsen HS | Multiples alignment, Phylogenie | Lamparter |
| Montag, 23. Juni 2014 | 9:45-11:15 | Geb 10.50 Großer HS | Proteine (zum Praktikum) | Fischer |
| Dienstag, 24. Juni 2014 | 11:30-13:00 | Geb. 10.11 Hertz | In silico Protein Charakterisierung, 3D | Gescher |
| 14:00-18:00 | versch. Orte | Übungen Gruppen 1-4 | ||
| Mittwoch, 25. Juni 2014 | 9:45-11:15 | Geb. 30.22 Gaede HS | Yeast Screening (zum Praktikum) | Requena |
| 14:00-18:00 | versch. Orte | Übungen Gruppen 1-4 | ||
| Donnerstag, 26. Juni 2014 | 11:30-13:00 | Geb. 10.91 Grashof HS | In silico Klonierung | Kämper |
| 14:00-18:00 | versch. Orte | Übungen Gruppen 1-4 | ||
| Montag, 30. Juni 2014 | 9:45-11:15 | Geb 10.50 Großer HS | Yeast 2 Hybrid (zum Praktikum) | Kämper |
| Dienstag, 1. Juli 2014 | 11:30-13:00 | Geb. 50.31 HS 107 | Funktionelle Genomik | Fokina |
| 14:00-18:00 | versch. Orte | Übungen Gruppen 5-8 | ||
| Mittwoch, 2. Juli 2014 | 9:45-11:15 | Geb. 30.22 Gaede HS | High throughput sequencing | Armant |
| 14:00-18:00 | versch. Orte | Übungen Gruppen 5-8 | ||
| Donnerstag, 3. Juli 2014 | 14:00-18:00 | versch. Orte | Übungen Gruppen 5-8 |
Übungen
Die Übungen müssen bis 10. Juli per Email oder Dropbox bei dem Betreuer abgegeben werden.
| Tag | Uhrzeit | Thema | Dozent, Gruppen | Raum | Dozent, Gruppen | Raum |
| Dienstag, 24. Juni 2014 | 14:00-18:00 | Alignment | Lamparter 1,2 | 10.40 HS 1 | Fan 3,4 | 10.40 Raum 114, 1. Stock |
| Mittwoch, 25. Juni 2014 | 14:00-18:00 | Protein | Gescher 1,2 | Fokina 3,4 | ||
| Donnerstag, 26. Juni 2014 | 14:00-18:00 | Klonierung | Kämper 1,2 | 30.44 Raum 007 EG | Dötsch 3,4 | 30.44 Raum 007 EG |
| Dienstag, 1. Juli 2014 | 14:00-18:00 | Alignment | Lamparter 5,6 | 10.40 HS 1 | Fan 7,8 | 10.40 Raum 114, 1. Stock |
| Mittwoch, 2. Juli 2014 | 14:00-18:00 | Protein | Gescher 5,6 | Fokina 7,8 | ||
| Donnerstag, 3. Juli 2014 | 14:00-18:00 | Klonierung | Kämper 5,6 | Raum 007 EG | Dötsch 7,8 |
Programme
| Ape | http://biologylabs.utah.edu/jorgensen/wayned/ape/ | |
| Pymol | http://pymol.org/educational/ | |
| Muscle | http://www.drive5.com/muscle/downloads.htm | |
| Phylip |
http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/getme.html |
|
| ClustalX2 | http://www.clustal.org/clustal2/ | |
Gruppeneinteilung
Gruppe 1
Sabrina Gfrerer
Anna Loreth
Berit Nauerth
Sebastian Schieß
Christine Seemann
Donya Shapoori
Kathrin Stricker
Pia Sophie Freidel
Jasmin Frietsch
Hannah Heinrich
Gruppe 2
Jeannette Kappenberger
Anja Weiss
Jaana Westmeier
Jacqueline Mann
Cathrin Ott
Sören Seitz
Nahla Isso
Nathalie Müller
Julia Chalupsky
Gruppe 3
Natalie Grüdl
Annette Meynerts
Rebecca Maria Neun
Juliette Dassow
Ruben Gärtner
Steffen Heck
Annika Himmelsbach
Philipp Sauerland
Konstantin Keller
Thomas Walter
Gruppe 4
Qing Lei
Marjorie Schmid
Lisa Schreiber
Cornelius Schubert
Sebastian Vogel
Jonas Waber
Julia Weber
Mouhannad Moulla
Gruppe 5
Sascha Seidt
Anne-Sophie Seiffert
Anna Agathe Bayer
Alex Fenchel
Rima Siauciunaite
Lukas Spottke
Thomas Stümpfl
Gulnara Datukischvili
Gruppe 6
Sebastian Thomas Kühnl
Patrick Bitterwolf
Svenja Hansson
Tim Höschele
Anika Lipphardt
Elena Muñoz Perez-Vico
Jannis Julian Zarges
Fabian Zimmerer
Gruppe 7
Miriam Edel
Lasse Faber
Daniel Härrer
Ina Kolb
Bryan Lotz
Laura-Alina Philipp
Mischa Selig
Katja Irina Berghaus
Ilsa-Maria Daumann
Gruppe 8
Lisa Bergheimer
Lia Heiser
Christian Jonas Lapp
An Phuc Pham
Tamara Treptow
Jan Lars Rüping
Lara Stelmaszyk
Nora Weber
Julia Weiß
letzte Änderung 22.06.2014