Master Praktikum Protein Kristallisation Wintersemester 2014 2015
| Erste Folien zur Vorlesung |
| Phytochrom Folien |
| Photolyase Folien |
| Pymol |
Seminarraum 002 und Laborräume der Botanik 1, Gebäude 10.40
Im Praktikum werden zunächst die Versuche 1,3,6,7,8 unnd 9 aus dem Buch "Protein Crystallization" von Terese M. Bergfors (2008) durchgeführt. Beschreibungen im Buch (hier klicken für Internet Version) ab Seite 355.
Sie führen dann Kristallisationsversuche mit bakteriellen Phytochrome bzw. Photolyasen durch. Die Proteine werden im Praktikum exprimiert und gereinigt. Eine Fragestellung ist, ob Photolyase Kristalle im Licht anders kristallisieren als im Dunkeln.
Seminar: Thema 1-8 sind Themen aus dem Kristallisationsbuch von S. Doublie: Macromolecular Crystallography Protocols Band 1+2, 2007
Band_1.pdf und Band_2.pdf
Jeder Studierende erhält ein Thema.
Thema 1: A Generic Method for the Production of Recombinant Proteins in Escherichia coli Using a Dual Hexahistidine-Maltose-Binding Protein Affinity Tag. Joseph E. Tropea, Scott Cherry, Sreedevi Nallamsetty, Christophe Bignon, and David S. Waugh Bd. 1,pp. 1-20
Thema 2: Protein Engineering. Sonia Longhi, François Ferron, and Marie-Pierre Egloff; Bd. 1,pp. 59-90
Thema 3: Production of Selenomethionyl Proteins in Prokaryotic and Eukaryotic Expression Systems. Sylvie Doublié; Bd. 1, pp. 91-108
Thema 4: Screening and Optimization Methods for Nonautomated Crystallization Laboratories. Terese Bergfors; Bd. 1, pp. 131-152
Thema 5: Improving Marginal Crystals. Charles W. Carter, Jr. and Madeleine Riès-Kautt; Bd. 1, pp. 153- 174
Thema 6: Cryocrystallography of Macromolecules: Practice and Optimization. Elspeth Garman and Robin L. Owen; Bd. 2, pp. 1-18
Thema 7: Characterizing a Crystal From an Initial Native Dataset. Michael R. Sawaya ; Bd. 2, pp. 95-120
Thema 8: Molecular Replacement. Eric A. Toth; Bd. 2, pp. 121-148
Die Themen sind unter "Seminar" aufgelistet. An den jeweiligen Tagen stellen die Teilnehmer den zugeteilten Artikel vor. Dauer 15-30 min.
| Vorlesung 10:00-12:00 | Seminar 10:00-12:00 | |
| Montag, 20. Oktober 2014 | Einführung | |
| Dienstag, 21. Oktober 2014 | -- | -- |
| Mittwoch, 22. Oktober 2014 | Sicherheit, Laborbesprechung, Kristallisation 1 | |
| Donnerstag, 23. Oktober 2014 | Laborbesprechung, Kristallisation 1 | |
| Freitag, 24. Oktober 2014 | Laborbesprechung, Kristallisation 1 | |
| Montag, 27. Oktober 2014 | Laborbesprechung, Phytochrom | |
| Dienstag, 28. Oktober 2014 | -- | -- |
| Mittwoch, 29. Oktober 2014 | Laborbesprechung, Phytochrom | |
| Donnerstag, 30. Oktober 2014 | 9:00-10:30 Thema 1 und 2 | |
| Freitag, 31. Oktober 2014 | 9:00-11:00 Thema 3 und 4 | |
| Montag, 3. November 2014 | Laborbesprechung, Photolyasen | |
| Dienstag, 4. November 2014 | -- | -- |
| Mittwoch, 5. November 2014 | Thema 5 und 6 | |
| Donnerstag, 6. November 2014 | Thema 7 und 8 | |
| Freitag, 7. November 2014 | ||
| Montag, 10. November 2014 | Kristallisation 2 | |
| Dienstag, 11. November 2014 | ||
| Mittwoch, 12. November 2014 | ||
| Donnerstag, 13. November 2014 | Referate | |
| Freitag, 14. November 2014 | Klausur |
Detaillierter Zeitplan für Praktikum in pdf