Plant Cell Biology: Methods and Concepts

WAS? Vorlesung und Praktikum. WER? Prof. Dr. Peter Nick, Dr. Jathish Ponnu WANN? s. Plan . WO? Biologieturm, Gbd. 30.43, 5. OG. FÜR WEN? Master Biologie, Chemische Biologie, Bachelor Biologie, Angewandte Biologie, Chemische Biologie.

 

Spielregeln

  • Sicherheit: einmal jährlich müssen alle die automatische Sicherheitsbelehrung Gentechnik absolvieren. Zugang über Ilias  Testergebnis ausdrucken und als Beleg in die erste Sitzung mitbringen.
  • Übergabe: am Schluss müssen Sie Platz, Proben, Daten an Ihre Betreuungspersion und die Spindschlüssel an Frau Williams übergeben. Details finden Sie hier.
  • Spindschlüssel: gibt es im Sekretariat (Frau Williams), bei dem sie nach Ende des Moduls wieder abgegeben werden müssen.

 

Lernziele (Objectives of the Course)

 

  • Vertiefte Einführung in die Methoden und Konzepte der modernen pflanzlichen Zellbiologie.

  • Kompetenz in der Interpretation der gängigen Labormethoden.

  • Gründliches Verständnis dieser Methoden.

  • Heranführung an eigenständiges wissenschaftliches Denken, kritischer Umgang mit Primär- und Sekundärliteratur.

  • Zelluläre Aspekte der pflanzlichen Entwicklung.

 

 

 

Ablauf des Moduls (Organisation of the Module)

 

Das Modul wird in zwei Versionen angeboten:

  • Für Master-Studierende (Nachblock Wintersemester, als Forschungsmodul  in den Fächern Botanik, Entwicklungsbiologie, Molekularbiologie und Zellbiologie, Studiengang Chemische Biologie). Beginn Mo 23.02.2026, 11:00 (SR 506-507, Gbd. 30.43).
  • Für Bachelor-Studierende (Nachblock Wintersemester, als Wahlpflichtversion von BA 07/ANG 07 Biologische Forschung, Chemische Biologie). Beginn mit der ersten Vorlesung, Mi 04.03.2026, 10:00 (SR 506-507, Gbd. 30.43).

Der Vorlesungsteil (Plant Cell Biology - Methods and Concepts) ist für beide Versionen gleich (Vorlesungstermine). Übungen, und die Durchführung des Praxisteils unterscheiden sich (Details finden Sie auf den oben verlinkten Seiten). Die Abschlusspräsentationen und die Klausur finden wiederum gemeinsam statt.

Für den Master Biologie kann dieses Modul auch als Projektmodul in den Fächern Botanik, Entwicklungsbiologie, Molekularbiologie und Zellbiologie belegt werden. In diesem Falle wird keine Note erhoben und man muss keine Klausur absolvieren. Der Erfolg des Moduls wird in Form einer Präsentation und eines Protokolls überprüft. Für Chemische Biologie kann das Modul als Teil eines Vertiefermoduls gewählt werden. Hier muss man dann individuelle Lösungen vereinbaren.

Termin Abschlusskolloquium Di 31.03.2026, 10:00-12:00 (Vortragsdauer ungefähr 20 min) - im Anschluss daran Übergabe Laborplatz, Daten und Proben

Termin Klausur Mi 01.04.2026, 10:00-12:00 (SR 506-507)

 

Projekte Frühjahr 2026 

 

Für wen? Bachelor, Master

Wo? Nick-Labor, Bioturm 5. OG. Untergruppe Zelluläre Biotechnologie. mehr...

Betreuung? M. Sci. Jiang Wu. e-mail...

Hintergrund zum Projekt? Ein Mikrotubulimotor, der als Stress-Sensor wirkt. mehr...

Start? Kick-off Termin Master Mo 23.02.2026, 11:00, Bachelor Mi 04.03.2026, 11:45 (nach der ersten Vorlesung), Seminarraum 506-507, Bioturm

Wieviel Leute? 2 Master+2 Bachelor

Anschlussmöglichkeit: Bachelorarbeit, P-Modul oder Masterarbeit

Für wen? Bachelor, Master

Wo? Nick-Labor, Bioturm 5. OG. Untergruppe Zelluläre Biotechnologie. mehr...

Betreuung? Dr. Jathish Ponnu e-mail..., Xiao Chen.

Hintergrund zum Projekt? Die amphibische Pflanze Hygrophila bildet unterschiedliche Blätter, abhängig davon, ob sie unter Wasser oder an der Luft ist. Die Arbeitsgruppe von Dr. Ponnu entwickelt dieses Phänomen als Modell, um die umweltabhängige Veränderung der pflanzlichen Morphogenese zu untersuchen. Im diesjährigen Projekt geht es darum, wie das Pflanzenhormon Abscisinsäure hier angekoppelt wird. Herr Chen hat hierzu ein molekulares Arbeitsmodell entwickelt, in dessen Zentrum die Proteinkinase SnRK2 steht. Sie können an diesem Beispiel lernen, wie man mithilfe eines Modells ein Forschungsprojekt strukturiert. Diese sogenannte hypothesengeleitete Strategie gilt als Goldstandard bei der Grundlagenforschung. mehr...

Start? Kick-off Termin Master Mo 23.02.2026, 11:00, Bachelor Mi 04.03.2026, 11:45 (nach der ersten Vorlesung), Seminarraum 506-507, Bioturm

Wieviel Leute? 2 Master+2 Bachelor

Anschlussmöglichkeit: Bachelorarbeit, P-Modul oder Masterarbeit

Für wen? Bachelor, Master

Wo? Nick-Labor, Bioturm 5. OG. Untergruppe Zelluläre Biotechnologie. mehr...

Betreuung? Dr. Jathish Ponnu e-mail..., Qianwei Liu.

Hintergrund zum Projekt? Immerse yourself in the fascinating world of plant biology with a bachelor’s project centred on a large protein complex that plays vital roles in processes ranging from light signalling to flowering by acting as a ubiquitin ligase. We believe we’ve identified a novel interaction partner for this complex, and your task will be to confirm this interaction, which appears essential for the plant's survival.You will utilize techniques such as Yeast Two-Hybrid (Y2H), split-luciferase assay, and confocal microscopy to validate the interaction both in planta and ex planta. Additionally, you will check the localization of this novel protein within plant cells and analyze its transcript levels using RT-qPCR to gain insights into the molecular dynamics involved. Specific projects in 2026: 1. Role of the CUL4–C3D complex. Students will analyze phenotypes of different transgenic lines and mutants under blue-light conditions and perform various molecular analyses related to how CRY impact on the C3D complex. 2. Search for a new potential substrate of DDA1. In a previous yeast two-hybrid screen, LRL2 was identified as a possible DDA1 interactor. LRL genes are known to regulate root hair development in Arabidopsis, and loss of LRL function results in reduced root hair elongation and a short, spiky root hair phenotype. However, it is currently unclear whether LRL-mediated regulation of root hair development is influenced by blue light, and how this process might be linked to DDA1. In this project, students will will first confirm the interaction between DDA1 and LRL2 using different approaches (Y2H, BiFC, Split-LUC, Co-IP).

Start? Kick-off Termin Master Mo 23.02.2026, 11:00, Bachelor Mi 04.03.2026, 11:45 (nach der ersten Vorlesung), Seminarraum 506-507, Bioturm

Wieviel Leute? 2 Master+2 Bachelor

Anschlussmöglichkeit: Bachelorarbeit, P-Modul oder Masterarbeit

Für wen? Bachelor, Master

Wo? Nick-Labor, Bioturm 5. OG. Untergruppe Zelluläre Biotechnologie. mehr...

Betreuung? M. Sci. Javier García Varo. e-mail...

Hintergrund zum Projekt? Hintergrund zu Stromuli. mehr...

Start? Kick-off Termin Master Mo 23.02.2026, 11:00, Bachelor Mi 04.03.2026, 11:45 (nach der ersten Vorlesung), Seminarraum 506-507, Bioturm

Wieviel Leute? 2 Master+2 Bachelor

Anschlussmöglichkeit: Bachelorarbeit, P-Modul oder Masterarbeit